سامانه همایش های دانشگاه جیرفت

صفحه اصلی / سومین همایش بین المللی و چهارمین همایش ملی کشاورزی، محیط زیست و امنیت غذایی

شناسایی فاکتورهای رونویسی مهم در ژن‌های افتراق بیان یافته در پاسخ به تنش خشکی در کلزا و ذرت

نویسندگان :

فاطمه محمودی خالدآبادی¹ علی مقدم² مرضیه مهری³

1- بخش بیوتکنولوژی دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز 2- بخش بیوتکنولوژی دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز 3- موسسه گیاه شناسی تجربی آکادمی علوم چک

کلمات کلیدی :

تنش خشکی،ذرت،فاکتورهای رونویسی،کلزا

چکیده :

هدف: مهم‌ترین هدف این پژوهش شناسایی فاکتورهای رونویسی که نقش فعالی در پاسخ به تنش خشکی در دو گیاه روغنی مهم اقتصادی کلزا و ذرت دارند میباشد. بررسی و شناسایی فاکتورهای رونویسی درک بهتری از فعالیت و مکانیسم‌های تنظیمی ژن‌های درگیر در پاسخ به تنش خشکی ارائه می‌دهد و برای پژوهش‌های بیشتر در اینده قابل توجه می‌باشند. مواد و روش‌ها: در ابتدا، ژن‌های افتراقی بیان‌یافته از داده‌های RNA-Seq برای ۱۰ مطالعه روی گیاه کلزا و 6 مطالعه روی گیاه ذرت مرتبط با تنش خشکی شناسایی شدند. سپس شناسایی فاکتورهای رونویسی برای گیاه Arabidopsis thaliana ، اورتولوگ ژن‌های بیان افتراق یافته برای هر دوگیاه مورد مطالعه کلزا و ذرت انجام شد. در ادامه فاکتورهای رونویسی مشترک در بین این دوگیاه که در پاسخ به تنش خشکی بررسی شدند .نتایج: فاکتورهای رونویسی که برای کلزا مشخص شدند در 12 خانواده قرار میگیرند که مهم‌ترین خانواده‌های مؤثر در پاسخ به نتش خشکی شاملAP2/ERF-ERF، bZIP، C3H، HB-HD-ZIP، MYB-related و NAC هستند. فاکتورهای رونویسی مشخص شده در گیاه ذرت متعلق به 11 خانواده هستندکه مهم‌ترین آن‌ها از نظر نقش در پاسخ به تنش خشکی به این شرح می‌باشند: AP2/ERF-ERF،MYB-related، HB-HD-ZIP، C3Hو zf-HD . بررسی‌های بیشتر نشان داد که فاکتورهای رونویسی MYB-related ، AP2/ERF-ERF ، HB-HD-ZIP و C3H بین دو گیاه کلزا و ذرت مشترک می‌باشند. نتیجه‌گیری: خانواده‌های مهمی از فاکتورهای رونویسی مرتبط با پاسخ به تنش خشکی در کلزا و ذرت شناسایی شدند. از میان آن‌ها، چهار خانواده مشترک شناسایی شد که اهمیت آن‌ها را نشان داده و برای پژوهش‌های آینده معرفی می‌شوند.