سامانه همایش های دانشگاه جیرفت

صفحه اصلی / سومین همایش بین المللی و چهارمین همایش ملی کشاورزی، محیط زیست و امنیت غذایی

شناسایی miRNAهای کنترل کننده عفونت ویروسی آنفولانزا در طیور

نویسندگان :

آزاده ترابی¹ زهرا رودباری²

1- موسسه تحقیقات علوم دامی کشور 2- دانشگاه جیرفت

کلمات کلیدی :

پروفایل بیانی،ژن های مقاوم به بیمار،ویروس آنفولانزا

چکیده :

هدف: ویروس H9N2 آنفولانزا به طور گسترده در پرندگان جهانی شیوع دارد و با کاهش رشد و تولید تخم مرغ، خسارات اقتصادی سنگینی به صنعت مرغداری وارد می‌کند. این ویروس علاوه بر ایجاد عفونت‌های شدید و تلفات، با کاهش اثر واکسن‌ها و القای عفونت‌های ثانویه، کنترل بیماری را دشوار می‌سازد. مطالعه تغییرات ژنی وشناسایی miRNAها می‌تواند راهکارهای نوینی برای مقابله ارائه دهد. مواد و روش‌ها: در این تحقیق، به‌منظور درک بهتر پاسخ میزبان به عفونت ویروسی، پروفایل بیان ژن‌ها در سلول‌های ریه مرغ آلوده به ویروس آنفولانزای (H5N1) طی ۲۴ ساعت مورد بررسی قرار گرفت. داده‌های ریزآرایه از پایگاه ArrayExpress استخراج و با استفاده از پکیج‌های تخصصی در نرم‌افزار R پردازش شدند. پس از نرمال‌سازی داده‌ها، ژن‌های با تغییرات بیان معنادار (|FoldChange>2| و P-value<0.05) شناسایی شدند. در ادامه، شبکه‌های تعاملی ژن‌ها با نرم‌افزار Cytoscape ترسیم و ژن‌های کلیدی (هاب) بر اساس درجه اتصال تعیین گردیدند. همچنین، miRNAهای تنظیم‌کننده این ژن‌ها با ابزارهای بیوانفورماتیکی پیش‌بینی شدند. نتایج: تجزیه و تحلیل داده ها منجر به شناسایی ۷۷۷۹ ژن تحت تاثیر عفونت شد که از این میان، ۸۸۳ ژن با تغییرات بیان چشمگیر (۵۱۲ ژن القاشده و ۳۷۱ ژن مهارشده) بود. آنالیز شبکه سه گره محوری (ژن‌های هاب) در شبکه را مشخص نمود: 1- ژن UBB (ژن کنترل کننده مسیر پروتئولیز(، 2- ژن PXDN (تعدیل ماتریکس خارج سلولی) و 3-ژن PIK3CA (ترانسداکشن پیام سلولی). شبیه‌سازی‌های بیوانفورماتیکی برهمکنش این ژن‌ها را با ۳۴ miRNA دارای نقش تنظیم ایمنی از جمله miR-155 و miR-146 (وابسته به التهاب) و نیز miR-21 (ضدویروس) و اعضای خانواده let-7 پیش‌بینی کرد که حاکی از مشارکت آن‌ها در تنظیم پاسخ‌های دفاعی میزبان است. نتیجه‌گیری: یافته‌های این مطالعه نشان می‌دهد که تحلیل جامع پروفایل های بیانی می‌تواند به درک بهتر پاتوژنز ویروس آنفولانزای پرندگان کمک کند. علاوه بر این، شناسایی miRNAهای کلیدی و ژن‌های هدف آن‌ها می‌تواند راه را برای توسعه استراتژی‌های درمانی نوین، از جمله طراحی واکسن‌های مؤثرتر یا روش‌های درمانی مبتنی بر RNA، هموار سازد. این نتایج گامی مهم در جهت کنترل بیماری‌های ویروسی در صنعت طیور محسوب می‌شود.