0% Complete
صفحه اصلی
/
سومین همایش بین المللی و چهارمین همایش ملی کشاورزی، محیط زیست و امنیت غذایی
متاآنالیز در گیاهان روغنی کلزا و ذرت و برای شناسایی ژنهای فعال در بیوسنتز اسیدهای چرب و پاسخ به تنش خشکی
نویسندگان :
فاطمه محمودی خالدآبادی
1
علی مقدم
2
مرضیه مهری
3
1- بخش بیوتکنولوژی دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز
2- بخش بیوتکنولوژی دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز
3- موسسه گیاه شناسی تجربی آکادمی علوم چک
کلمات کلیدی :
داده RNA-Seq،ذرت،کلزا،هستی شناسی ژن
چکیده :
هدف: هدف این پژوهش، شناسایی ژنهای مشترک فعال در پاسخ به تنش خشکی و بیوسنتز اسیدهای چرب در گیاهان کلزا و ذرت، از طریق متاآنالیز دادههای ترنسکریپتومی است. یافتهها میتوانند به بهبود اصلاح ژنتیکی ارقام متحمل و با کیفیت کمک کنند .مواد و روشها: در ابتدا، دادههای RNA-Seq از۱۰ مطالعه برای گیاه کلزا و 6 مطالعه روی گیاه ذرت که تحت تنش خشکی بودند شناسایی شدند. در ادامه پردازش داده ها و نرمالسازی آنها با استفاده از ابزار گلکسی انجام شد. سپس نرمالسازی نمونهها و شناسایی ژنهای افتراق بیان یافته با استفاده از متاآنالیز در زبان برنامه نویسی R انجام شد. جهت شناسایی ژنهای افتراق بیان یافته مشترک بین کلزا و ذرت، از اورتولوگهای آنها در Arabidopsis thaliana استفاده شد. در ادامه تحلیل هستی شناسی ژنهای افتراق بیان یافته مشترک در بین این دوگیاه در پاسخ به تنش خشکی برای تعیین عملکردهای زیستی آنها انجام شد .نتایج: در مجموع، ۱۵۶ ژن افتراق بیانیافته مشترک بین کلزا و ذرت شناسایی شد. تحلیل هستیشناسی این ژنها نشان داد که این ژنها در فرآیندهای بیولوژیکی شامل response to water deprivation ، very long-chain fatty acid biosynthetic procesو regulation of stomatal closure، دارای عملکردهای مولکولی مانند omega-3 fatty acid desaturase activity، acyl carrier activity ،calcium ion binding و oxidoreductase activity بوده و در مسیرهای متابولیکی نظیر polyunsaturated fatty acid biosynthesis، Lipid metabolismو phenylpropanoid biosynthesis نقش دارند. نتیجهگیری: ژنهای مهم افتراق بیانیافته که بهطور مشترک در کلزا و ذرت شناسایی شده و با پاسخ به تنش خشکی و بیوسنتز اسیدهای چرب مرتبط هستند، بهعنوان اهداف بالقوه برای پژوهشهای آینده معرفی میشوند.
لیست مقالات
لیست مقالات بایگانی شده
توسعه کاربردهای بستهبندی پایدار موادغذایی از فیلمهای ترکیبی کیتوزان/پلیوینیلالکل
حدیثه صادق زاده بجندی - ثمین صمدزاد - طرلان کرامتی - محمدحسین عبدلی حسین آبادی
بررسی اثرات نانو ذرات زینک اکساید و باکتری Bacillus velezensis بر روی میزان تبادلات گازی توت فرنگی تحت شرایط تنش قلیایی
عباس دانایی فر - اسمعیل خالقی
بررسی اثر تغییر اقلیم بر پراکنش و پویایی حشرات آفت
پریسا اسحاقی - وحید اعتماد - محمدابراهیم فرآشیانی - شهرام خلیقی سیگارودی - محمدحسین ارسلانلو
استفاده از پسماندهای کشاورزی برای تولید انرژی
هیمن خودکام - احسان باقری
بررسی اثر کود سولوپتاس بر عملکرد و اجزا عملکرد دو رقم اصلاحشده باقلا و یک توده بومی (Vicia faba L.) در شهرستان خاش
مسعود میرکازهی - مهدیه امیرینژاد - خالد میری
اثر تراکم بوته و تاريخ كاشت بر برخی ویژگیهای زراعی بادام زمینی (Arachis hypogaea L.)
مصطفی احمدی - صدیقه احمدی
بررسی پالایش خاکهای آلوده به فلزات سنگین با استفاده از درختان
بهروز کرد - امین خادمی - سارا پورعباسی
ترکیب هوش مصنوعی و اینترنت اشیا: دگرگونی نظارت و مدیریت محصولات در کشاورزی دقیق
محمد جواد ادیبیان
ارزیابی سه روش مختلف تجربی (هارگریوز - تورگ - فائوپنمن مانتیث) و تخمین تبخیر و تعرق پتانسیل در ایستگاه سی سخت در استان کهگیلویه و بویراحمد
غلامرضا علی پور مداب - ریحانه اسدی
اولین گزارش ویروس ساقه آبلهای سیب (Apple stem pitting virus (Foveavirus mali) , ASPV) از باغات گلابی در استان کرمان
نجمه عظیمی - احمد حسینی - خلیل ملک زاده
بیشتر
ثمین همایش، سامانه مدیریت کنفرانس ها و جشنواره ها - نگارش 42.0.2