0% Complete
صفحه اصلی
/
سومین همایش بین المللی و چهارمین همایش ملی کشاورزی، محیط زیست و امنیت غذایی
متاآنالیز در گیاهان روغنی کلزا و ذرت و برای شناسایی ژنهای فعال در بیوسنتز اسیدهای چرب و پاسخ به تنش خشکی
نویسندگان :
فاطمه محمودی خالدآبادی
1
علی مقدم
2
مرضیه مهری
3
1- بخش بیوتکنولوژی دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز
2- بخش بیوتکنولوژی دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز
3- موسسه گیاه شناسی تجربی آکادمی علوم چک
کلمات کلیدی :
داده RNA-Seq،ذرت،کلزا،هستی شناسی ژن
چکیده :
هدف: هدف این پژوهش، شناسایی ژنهای مشترک فعال در پاسخ به تنش خشکی و بیوسنتز اسیدهای چرب در گیاهان کلزا و ذرت، از طریق متاآنالیز دادههای ترنسکریپتومی است. یافتهها میتوانند به بهبود اصلاح ژنتیکی ارقام متحمل و با کیفیت کمک کنند .مواد و روشها: در ابتدا، دادههای RNA-Seq از۱۰ مطالعه برای گیاه کلزا و 6 مطالعه روی گیاه ذرت که تحت تنش خشکی بودند شناسایی شدند. در ادامه پردازش داده ها و نرمالسازی آنها با استفاده از ابزار گلکسی انجام شد. سپس نرمالسازی نمونهها و شناسایی ژنهای افتراق بیان یافته با استفاده از متاآنالیز در زبان برنامه نویسی R انجام شد. جهت شناسایی ژنهای افتراق بیان یافته مشترک بین کلزا و ذرت، از اورتولوگهای آنها در Arabidopsis thaliana استفاده شد. در ادامه تحلیل هستی شناسی ژنهای افتراق بیان یافته مشترک در بین این دوگیاه در پاسخ به تنش خشکی برای تعیین عملکردهای زیستی آنها انجام شد .نتایج: در مجموع، ۱۵۶ ژن افتراق بیانیافته مشترک بین کلزا و ذرت شناسایی شد. تحلیل هستیشناسی این ژنها نشان داد که این ژنها در فرآیندهای بیولوژیکی شامل response to water deprivation ، very long-chain fatty acid biosynthetic procesو regulation of stomatal closure، دارای عملکردهای مولکولی مانند omega-3 fatty acid desaturase activity، acyl carrier activity ،calcium ion binding و oxidoreductase activity بوده و در مسیرهای متابولیکی نظیر polyunsaturated fatty acid biosynthesis، Lipid metabolismو phenylpropanoid biosynthesis نقش دارند. نتیجهگیری: ژنهای مهم افتراق بیانیافته که بهطور مشترک در کلزا و ذرت شناسایی شده و با پاسخ به تنش خشکی و بیوسنتز اسیدهای چرب مرتبط هستند، بهعنوان اهداف بالقوه برای پژوهشهای آینده معرفی میشوند.
لیست مقالات
لیست مقالات بایگانی شده
ارزیابی ریسک بهداشتی ناشی از مصرف کودهای نیتراته در برخی از محصولات پرمصرف کشاورزی در شهرستانهای کرمان و جیرفت
مسلم بسیج - فریده گنجوی - ایمان شریفیان
بررسی اثر جایگزینی کنجاله سویا با خوراک فضولات طیورغنی شده با لارو مگس در جیره بر فراسنجه های تولید گاز در برههای پرواری قره گل
مجید یعقوب زاده - محبوبه حور - فریبا فریور
تاثیر پوشش کربوکسی متیل سلولز بر خصوصیات فیزیکوشیمیایی انبه برداشت شده طی زمان ماندگاري
ملیکا براهوئی کنگوری - عارفه حسنوند
Identifying Locations Prone to Algal Blooms using Satellite Imagery
Hamid Bagheri - Goli Sedighi
مقایسه روشهای مختلف پیشبینی روند مصرف انرژیهای تجدیدناپذیر در ایران
فاطمه وزیری نسب
ترکیبات زیستی راهکار بهبود و ارتقاء پایداری اکوسیستمها
سمیه بدخشان - عنایت اله توحیدی نژاد - جلال قنبری - بهاره پارسا مطلق
تأثیر روش¬های نوین بسته¬بندی زیست¬تجزیه¬پذیر بر محیط زیست
حدیث شیرخانی - آریو امامیفر
بررسی رابطه بین ارزشافزوده بخش کشاورزی و مصرف انرژی (مدلسازی با روش خودرگرسیون برداری در ایران)
علیرضا کرباسی - سارا بزرگ چنانی
نقش قرآن در تمدنسازی اسلامی معاصر و شکلگیری تمدن نوین اسلامی
رضا ملازاده یامچی - سید مهدی مصطفوی
روشهای فیزیکوشیمیایی تلخیزدایی از بادام وحشی
احسان شاهمرادی - سپیده خراسانی - کاظم جعفری نعیمی - حمید رضا اخوان
بیشتر
ثمین همایش، سامانه مدیریت کنفرانس ها و جشنواره ها - نگارش 42.0.2